協會成立於2003年6月。成立之初，因多數會員為製造商及合同製造商，名為香港醫療及保健器材製造商協會。
及後由於會員數目持續增長及會員業務性質覆蓋至醫療器材行業的整個生產鏈，包括設計公司、元件製造商、貿易公司、認證公司，於2008年10月易名為香港醫療及保健器材行業協會。
自2025年3月起，協會更名為香港醫療科技協會。
近年來，醫療科技領域迅速發展，從傳統器材設備擴展至人工智能、數字健康、遠程醫療、機器人技術及數據驅動診斷等科研領域。「醫療科技」成為這一演變的統稱，展現醫學與科技的深度融合。
此次更名象徵協會不斷推動醫療技術創新、繼續加強行業合作，與業界攜手共創醫療科技新時代。
協會的新標誌展示了醫療專業人士、研發專業人士、製造商、使用者、監管機構、學術界及行業持份者之間互相合作，共同構建協作共融的平台。
